ОАО «НИИЭС» имеет следующие лицензии и сертификаты:
- Лицензия Минпромторга на осуществление разработки, производства, испытания и ремонта авиационной техники
- Лицензия ФСБ на проведение работ, связанных с использованием сведений, составляющих государственную тайну
- Сертификат соответствия СМК требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2015 и ГОСТ РВ 0015-002-2012
